Naruto: Shippūden (jap. ナルト 疾風伝)
stanowi kontynuację serii, jej fabuła zaczyna się, gdy piętnastoletni Naruto Uzumaki wraz ze swoim nauczycielem Jiraiyą powraca po dwóch i pół roku nieobecności do wioski Konoha. Jest nieco bardziej dojrzały niż w pierwszej części. Jego głównym celem jest ocalenie przyjaciela Sasuke z rąk Orochimaru. Oczywiście po drodze będzie musiał stawić czoło głównemu wrogowi, czyli organizacji Akatsuki, która będzie chciała schwytać wszystkie ogoniaste bestie i wykorzystać je dla własnych celów.
Po uratowaniu Gaary, Naruto wyrusza na kolejną misję. Dochodzi do spotkania zaginionego przyjaciela i wywiązuje się pomiędzy nimi walka. Młody Uzumaki nie ma szans z Sasuke, który ma nad nim ogromną przewagę. Gdy powraca do wioski, by stać się silniejszym, poddaje się wycieńczającemu treningowi. Ma na to tylko pół roku. W walce z Akatsuki ginie Sarutobi Asuma. Naruto znów staje do walki z wrogą organizacją. Udaje mu się udoskonalić Rasengana i niszczy nim Kakuzu, jednego z członków Akatsuki. Sasuke pokonuje Orochimaru i tworzy grupę Hebi. Wraz z nowymi sprzymierzeńcami rusza za swoim bratem, a kiedy go znajduje, po długiej walce zabija go. W tym samym czasie Jiraiya odnajduje tajemniczego szefa Akatsuki – Paina – i ginie z jego ręki. Naruto zaczyna trening w ropuszej wiosce, a Pain atakuje Konohę. W niemal całkowicie zniszczonej Wiosce Ukrytego Liścia pojawia się główny bohater i pokonuje Paina. Nagato wskrzesza zmarłych w walce. Sasuke staje się członkiem Akatsuki i atakuje Killera Bee. Nowym Hokage zostaje Danzo i wydaje rozkaz likwidacji zbiegłego Uchihy.
Drugi sezon również został wyprodukowany przez studio Pierrot. Seria była emitowana po raz pierwszy na kanale TV Tokyo Network od 15 lutego 2007 roku do 23 marca 2017 roku i składa się z 500 odcinków po 30 minut.
Filmy pełnometrażowe
| Lp. |
Tytuł |
Data premiery (Japonia) |
| 1 |
Gekijōban Naruto: Daikatsugeki! Yuki-hime ninpōchō dattebayo!! |
21 sierpnia 2004 |
| 2 |
Gekijōban Naruto: Daigekitotsu! Maboroshi no chiteiiseki dattebayo |
6 sierpnia 2005 |
| 3 |
Gekijōban Naruto: Daikōfun! Mikazukijima no animaru panikku dattebayo |
5 sierpnia 2006 |
| 4 |
Gekijōban Naruto shippūden |
4 sierpnia 2007 |
| 5 |
Gekijōban Naruto shippūden: Kizuna |
2 sierpnia 2008 |
| 6 |
Gekijōban Naruto shippūden: Hi no ishi o tsugu mono |
1 sierpnia 2009 |
| 7 |
Gekijoban Naruto shippuden: The Lost Tower |
31 lipca 2010 |
| 8 |
Gekijōban Naruto: Blood Prison |
30 lipca 2011 |
| 9 |
Road to Ninja: Naruto the Movie |
28 lipca 2012 |
| 10 |
Naruto Shippuden the Movie: Blood Prison |
6 grudnia 2014 |
| 11 |
Boruto: Naruto the Movie |
7 sierpnia 2015 |
